Parodie de la série Mega Man X, l’histoire se déroule dans un futur lointain où les humains ont asservis leur création robotique appelés "Reploids", l'un d'entre-eux Sigma, une célébrité de sa génération. Pris d'une défaillance après une soirée bien arrosée, il décida sur un coup de tête de lever une armée de Reploids déviants, appelés ''Mavericks'', afin de combattre tous les systèmes capitalistes abusifs.
Cependant, des Chasseurs de Maverick lui barreront la route pour maintenir le statut-quo. X, la création ultime du Dr. Light possédant la capacité unique de venir à bout toute menace nuisible en étant lui-même un casse-pied, et accompagné de son allié Zero... le mec cool. X fera tout pour combattre et arrêter Sigma dans son élan révolutionnaire.