"Haeretici" se passe dans un monde médiéval où la religion catholique fait pression sociale. Moines, prêtres se battent sans cesse contre le "mal" et essaient par tous les moyens de protéger la population. Les personnes considérées comme hérétiques sont brulées vives pour leur procurer une mort longue et douloureuse.
Marie est suspectée de pratiquer la sorcellerie sur son mari, ces événements vont la conduire tout droit vers la mort, jusqu'à ce qu'un jeune voyageur la retrouve au fond d'un lac...