Yona Okotsu, 25 ans, quitte l’armée de terre après 8 ans de service et retourne au Japon retrouver sa sœur, Mey. Alors qu’il pense enfin avoir dit adieu à sa vie d’avant et souhaite vivre normalement et paisiblement, une suite d’événements vont mener des clans rivaux à Tokyo à un règlement de compte ultra violent au restaurant là ou Yona et sa sœur avaient décidé de déjeuner. Seul après la mort de sa sœur, et avec une rage indescriptible, Yona choisira le chemin de la vengeance, et va commencer à massacrer des yakuzas la nuit, jusqu’à pouvoir remonter à ceux qui ont tué sa sœur et satisfaire sa soif de sang. Sa vengeance sans fin va le mener à tuer malgré lui la mauvaise personne et à relâcher un monstre bien pire que les criminels qu’il massacre la nuit, qui a pour seul objectif le chaos et la destruction. Les deux personnages vont se livrer un combat d’une fureur absolue. Sa quête sanglante va mettre à feu et à sang Tokyo, et mettre Yona face aux conséquences de ses actions.